南京市总工会成立于1927年3月，是中国共产党领导下成立的南京第一个地方工会。南京市总工会是中华全国总工会的地方组织，由南京市工会代表大会选举产生，是南京市各级工会组织的领导机关。

1927年3月25日，全市200多个基层工会派代表参加市工人代表大会，正式成立南京市总工会，选举文化震、钟天樾、梁永等25人组成执行委员会。会址设在夫子庙贡院（今江南贡院）明远楼。在中国共产党领导下，南京工会为维护广大职工合法权益、实现民族独立和人民解放、促进南京改革发展作出了不可替代的贡献。2020年9月，南京市总工会第十七次代表大会成功召开，选举产生了南京市总工会第十七届工会委员会。

90多年来，随着南京工人阶级队伍由小到大、由弱变强，南京市总工会由成立之初的200多个基层组织、5万多名会员，发展到今天5.7万多个基层组织、232万多名会员，工会自身规模不断发展壮大。目前，南京市总工会直属区总工会、产业（开发区、公司）工会、市级机关工会联合会35家，市总机关设置14个职能部门：办公室（研究室）、组织部、宣传教育部、权益保障部、劳动和经济工作部、基层工作部、网络工作部、法律工作部、女职工部（市总工会女职工委员会办公室）、财务部、审计处（市总工会经费审查委员会办公室）、资产管理部、机关党委、老干部处。下属南京市工人文化宫、南京市职工技协办公室、南京市职工大学、南京市总工会干部学校、南京市职工宣传教育中心、南京市职工疗养院、南京市职工对外交流中心、南京市职工互助互济会、南京市职工服务中心、南京天丰投资管理有限责任公司、南京天丰企业发展集团中心、南京天丰大酒店等企事业单位。

90年多来，南京市总工会坚持发挥好党联系群众的桥梁和纽带作用，始终与广大职工群众同呼吸、共命运，努力实现好、维护好、发展好职工群众的根本利益。近年来，南京市总工会在中共南京市委和上级工会的坚强领导下，依据《工会法》和《中国工会章程》，锐意进取、真抓实干，深入实施党的群团工作会议精神落实行动、“强富美高”建功立业行动、服务职工提升行动、基层组织建设强化行动、职工保障维权行动“五大行动”计划，聚焦聚力 “深化工会改革、助推创业创新、服务职工群众、加强自身建设”四大工作重点，团结带领广大职工为建设“强富美高”新南京作出了积极贡献。2017年，全市各级工会紧紧围绕“两聚一高”和“一个高水平建成、六个显著”奋斗目标，全行业劳动竞赛如火如荼，举办全市职工职业（行业）技能大赛117场，1.3万人次晋升技术等级。积极开展“劳模创新工作室”、“职工创新工作室”创建工作，沙夕兰劳模创新工作室成为“全国示范性劳模和工匠人才创新工作室”。扎实做好工会就业援助工作，全年培训职工7093人次，安置就业3109人次，发放小额创业贷款4897万元，市总被评为“全省工会职工服务平台建设省级示范单位”。大力开展职工互助互济活动，2019年，市级互助会员净增4.5万人，南京市职工互助互济会支付各项互助待遇3737万元，惠及市级互助会员近2万人次。此外，南京市互助互济会还向3081名特困互助会员合计发放了340万元的特困互助会员慰问帮扶金。实施农民工“求学圆梦行动”和农民工子弟学校“志愿助教行”等活动，制定首个职工公益服务类地方标准《工作场所爱心母婴室建设及星级评定规范》，职工群众的获得感幸福感不断提高。全力促进和谐劳动关系深化发展，制定《关于深化集体协商助推创新富民工作的意见》并被省总转发，发放集体协商要约书1.4万份，制定《关于加强非公企业职代会工作的意见》，市总被评为“全省推动厂务公开民主管理先进单位”。积极开展法律援助活动，代理援助案件231件、挽回经济损失826万元，市总荣获“国家彩票公益金法律援助项目示范单位”称号。稳步推进“互联网+工会”行动计划，会员实名制数据采集155万条、注册45万人，南京工会智能化信息服务平台正式上线，实现市总与直属工会网上办公互联互通。开发南京工会会员服务平台，发展平台合作伙伴124家、普惠服务网点超过3000个，通过线上“周周抢”、线下“周周见”、会员“入会有礼”等特色活动，进一步扩大普惠服务的覆盖面和影响力，“南京工会”APP进入全国最有影响力工会客户端前十名。